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BIOgarabatos

Garabateando ideas sobre ciencia, biociencias, metaciencia, información, informática, conocimiento datos e historia
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Al describir la información sobre el color y los patrones de coloración en los seres vivos relacionamos una gran cantidad de variables, una de las más interesantes es la función de la coloración por su importancia biológica. Ahora estamos indagando sobre la mejor manera de describir esa función utilizando los elementos y las propiedades de Wikidata.

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Estamos realizando un experimento in silico con Wikidata para generar biodatos sobre el color de los organismos que obtenemos de los artículos científicos, de tal manera que, aplicamos la tecnología semántica para generar datos estructurados, abiertos, públicos, reutilizables  y disponibles para todos, que además permitan generar y difundir mapas de nuevo conocimiento  biológico.

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Wikidata tiene un gran potencial para producir aplicaciones, estas son herramientas que han diseñado los usuarios basados en la información que indexa la plataforma para generar análisis y visualizaciones que son dinámicas, automáticas, y abiertas veamos algunas de las que más me gustan: https://wikipulse.com/ https://scholia.toolforge.org/ https://wikxhibit.org/ https://isobelm.github.io/Software-Engineering/#/ https://dataviz.toolforge.org/

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Dentro del proyecto denominado "Código salud" hemos estado curando información sobre los hospitales de México en Wikidata para agregar información estructurada que permita tomar decisiones, una de las variables de nuestro interés son los tratamientos que se pueden realizar en estos nosocomios, en especial los que salvan más vidas como: infarto agudo al miocardio e infarto cerebral.

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Scholia es una plataforma asociada a Wikidata que permite obtener poderosas visualizaciones de datos de la información estructurada en Wikidata, hasta el momento se puede visualizar la información desde dos perspectivas: taxonómica  y bibliográfica, la información en este recurso se organiza en tablas y gráficos dinámicos que facilitan interactuar con la información en tiempo real.

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El 9 de diciembre del 2022 participamos en el evento Diálogos docentes: experiencias integrando Wikimedia en las aulas con el seminario Herramientas Wiki para la Alfabetización Digital organizado por Wikimedia Edicación Programa -"Wikipedia en los planes de estudio: estrategias de implementación, diseño curricular y formación docente" Expone: Jonathan Jiménez (México)

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El 4to Encuentro WikiEducación es un evento virtual organizado por el programa de educación de la fundación Wikimedia se llevará a cabo el 16 y 17 de junio.  ** ** La exposición El 17 de junio de 2023 de 11:45 a 13:45 me toca presentar las distintas maneras en las que el laboratorio virtual de Bioinformación utiliza los proyectos de la Fundación Wikimedia, en especial Wikidata en la educación.

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La Web semántica consiste en generar contenidos en la Web que estén etiquetados y marcados con metadatos que describan el significado a través de tripletes, para esto se usa el lenguaje semántico RDF. Una vez estructurada la información semánticamente, es posible generar conjuntos de datos que sean procesables y realizar análisis y visualizaciones con ellos. SPARQL es el lenguaje diseñado para realizar consultas en un conjunto de RDFs.